İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa bünyesinde 12 Fakülte, 6 Enstitü, 1 Yüksekokul, 5 Meslek Yüksekokulu ve 17 Uygulama ve Araştırma Merkezi bulunmaktadır.
Fakülteler:
Cerrahpaşa Tıp Fakültesi
Florence Nightingale Hemşirelik Fakültesi
Mühendislik Fakültesi
Spor Bilimleri Fakültesi
Orman Fakültesi
Diş Hekimliği Fakültesi
Veteriner Fakültesi
Eczacılık Fakültesi
Hasan Âli Yücel Eğitim Fakültesi
İşletme Fakültesi (Kuruluş Aşamasında)
Sağlık Bilimleri Fakültesiİktisat Fakültesi (Kuruluş Aşamasında)Enstitüler:
Adli Tıp ve Adli Bilimler Enstitüsü
Nanoteknoloji ve Biyoteknoloji Enstitüsü
Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
Akciğer Hastalıkları ve Tüberküloz Enstitüsü
Kardiyoloji Enstitüsü
Nörolojik Bilimler EnstitüsüYüksekokul:
Meslek Yüksekokulları:
Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu
Veterinerlik Meslek Yüksekokulu
Ormancılık Meslek YüksekokuluSosyal Bilimler Meslek Yüksekokulu
Sağlık Hizmetleri Meslek YüksekokuluUygulama ve Araştırma Merkezleri:
- Açık ve Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Ağız ve Diş Sağlığı Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Behçet Hastalığı Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Biyomedikal Mühendisliği Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Çevre ve Yer Bilimleri Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Çocuk Akademisi Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Enerji Yönetimi Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Geleneksel ve Tamamlayıcı Tıp Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Gıda Antioksidanları Ölçümü Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Hipofiz Hastalıkları ve Tümörleri Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Kariyer Planlama Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Klinik Araştırmalar Mükemmeliyet Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Ormancılık Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Osteoarkeoloji Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Sağlık Kuruluşları İçin Çevre Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Sürekli Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi